El 13 de setiembre de 2009, por Ley Nº 18.567, se creó un tercer nivel de gobierno y administración llamado Municipio (se los conoce también como Alcaldías). El objetivo de los municipios es instalarse como órgano de gobierno local y como la jurisdicción territorial donde se establecerán estos gobiernos locales. Son conformados por cinco miembros; el presidente del órgano recibe el nombre de "alcalde" y los demás miembros el de "concejales". Los miembros se eligen por voto directo de la ciudadanía en la misma oportunidad en la que se eligen los Intendentes y las Juntas Departamentales.